В областта на редуцирането на емисии от парникови газове КоГен Инженеринг работи предимно самостоятелно, което не изключва партньорство с други фирми. Например при изпълнението на някои от проектите (СИ), КоГен Инженеринг партнира с Холандската фирма Global Carbon.
КоГен Инженеринг е отворен за партньорство с други фирми, като предвижда съвместна работа особено при реализацията на проекти извън територията на Република България.